O EnAJUS teve início em 2018, e as suas duas primeiras edições, 2018 e 2019, realizadas em Brasília, Brasil, resultaram do trabalho cooperativo do grupo de pesquisa Administração da Justiça (AJUS), dos programas de pós-graduação em Administração e em Direito, ambos da Universidade de Brasília, do Centro de Administração e Políticas Públicas (CAPP) da Universidade de Lisboa, e do Instituto Brasileiro de Estudos e Pesquisas Sociais (IBEPES). A edição de 2020 teve Curitiba, Brasil, como cidade-sede e foi promovida no formato online, em decorrência da pandemia COVID-19. Juntaram-se ao grupo organizador do evento dois novos atores importantes: a Universidade Positivo (UP), por meio dos programas de pós-graduação em Administração e em Direito, e a Direção-Geral de Política de Justiça (DGPJ), do Ministério da Justiça de Portugal.
Em 2021 o EnAJUS foi realizado em formato híbrido, com atividades presenciais em Lisboa, Portugal, e atividades remotas e transmissão ao vivo pela internet. Ao grupo organizador anterior juntaram-se o Instituto de Investigação Interdisciplinar (IURIS), da Universidade de Lisboa, e os grupos de pesquisa Administração, Governo e Políticas Públicas do Poder Judiciário (GPJUs) e Gestão, Desempenho e Efetividade do Judiciário (GEJUD), do Brasil.
O EnAJUS 2022 foi realizado em Curitiba, Brasil, no formato presencial, com opção de participação remota para autores residentes fora do Brasil. A Escola de Formação Judiciária do Tribunal de Justiça do Distrito Federal e Territórios (EJuDFT), Brasília, Brasil, a Faculdade de Direito da Universidade de Coimbra (FDUC), Coimbra, Portugal e o Instituto Brasileiro de Administração do Sistema Judiciário (IBRAJUS) passaram a integrar, em 2022, o conjunto de instituições e grupos de pesquisa responsável pela realização do evento. Em 2022 foi instituído o Prêmio Tomas de Aquino Guimarães de Melhores Trabalhos EnAJUS, atribuído a três trabalhos, um de cada categoria – Trabalho Empírico, Ensaio Teórico e Relatório Técnico. A outorga de prêmios aos melhores trabalhos passou a fazer parte da rotina do evento desde então.
A sexta edição do EnAJUS, realizada em 2023, em Brasília, teve como instituição anfitriã o Centro Universitário IESB, e Acesso à Justiça como tema central. Acesso à justiça é tema complexo e polissêmico, que vai além do acesso aos órgãos de justiça e constitui grande desafio de sociedades em geral, especialmente nos países em desenvolvimento. Como tal, o tema foi tratado de forma transversal associado a diversos outros temas, como tecnologia, governança, políticas públicas etc. Destaca-se, nessa sexta edição, o apoio institucional do Conselho Nacional de Justiça (CNJ), em razão do alinhamento do evento com a política de pesquisas judiciárias e ciência de dados, constante da Resolução nº 462/2022. O evento contou com uma conferência de abertura, tratando do tema “políticas públicas e acesso à justiça”, e com três painéis temáticos, os quais discutiram temas como a formação dos profissionais da Justiça, tecnologia e inovação, além da questão das interseccionalidades no acesso à justiça. Houve também o oferecimento de três minicursos de formação em pesquisa, sendo um deles presencial e os demais no formato telepresencial.
Em 2024, o EnAJUS foi realizado em Natal, RN, no período de 26 a 29 de novembro, tendo como anfitriões o Programa de Pós-Graduação em Administração (PPGA), da Universidade Potiguar (UNP), e o Programa de Pós-Graduação em Direito (PPGD), do Centro de Ciências Sociais (CCSA) da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN). Neste ano, o tema central foi Paz, Justiça e Instituições Eficazes, em conexão ao título do Objetivo 16 de Desenvolvimento Sustentável (ODS 16) da Agenda 2030 da Organização das Nações Unidas – ONU (2020). Novamente, o EnAJUS recebeu o apoio institucional do Conselho Nacional de Justiça (CNJ), que foi somado aos apoios do Instituto de Pesquisas Econômicas Aplicadas (IPEA), da Escola Nacional de Formação e Aperfeiçoamento de Magistrados (ENFAM), da Escola de Formação Judiciária (EJuDFT), do TRT da 21ª região, da Associação dos Magistrados do Trabalho da 21ª região, além da Capes e do CNPq.
A edição de 2024 foi a que recebeu o maior número de trabalhos submetidos desde o início do EnAJUS. Foram recebidas 224 submissões, das quais, 160 foram selecionadas e 112 fizeram parte das 28 sessões de trabalhos apresentados. O EnAJUS cresceu quase quatro vezes entre 2018 e 2024, quando passou de cerca de 60 para mais de 220 submissões nesse período. A competição aumentou de cerca de nove para sete trabalhos selecionados de cada 10 submetidos no mesmo período. Isso evidencia elevação do nível de qualidade dos trabalhos e a importância crescente do evento na constituição de uma comunidade de pesquisadores interessados no tema da Administração da Justiça. O EnAJUS 2024 contou também com três painéis temáticos, três minicursos, reunião de grupos de pesquisa, sessão de lançamento de livros, exposição de dois observatórios de dados, além da palestra magna de abertura com a Procuradora-Geral de Justiça do Estado do Rio Grande do Norte.
O EnAJUS passou a reunir, em 2024, mais de 130 participantes, entre professores, pesquisadores, técnicos, gestores públicos, formuladores de políticas públicas, operadores do direito e estudantes de graduação e pós-graduação. Trata-se, portanto, de evento que se consolidou e tornou-se internacional rapidamente. O EnAJUS tornou-se realidade e um sucesso entre estudiosos e praticantes da Administração da Justiça por meio do trabalho voluntário de mais de uma centena de indivíduos, que atuaram como organizadores, palestrantes, autores de trabalhos, avaliadores e em atividades técnicas e de apoio operacional e logístico.
Em 2025, o EnAJUS será realizado em João Pessoa, PB, no período de 25 a 28 de novembro, tendo como anfitrião o Programa de Pós-Graduação em Administração (PPGA) da Universidade Federal da Paraíba (UFPB). Com tema central “Desafios e Oportunidades para o Sistema de Justiça na Sociedade da Informação”, o EnAJUS 2025 será recepcionado numa capital nordestina representativa do Sistema de Justiça – haja vista a presença significativa de diversos atores organizacionais judiciais atuantes em João Pessoa –, fortalecendo a expansão do evento nesta região, difundindo sua proposta e missão, ao mesmo tempo em que concilia tradição e tendência de futuro análogos ao momento vivido pela cidade.